MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 chromosome

Total Repeats: 94773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007908	GT	3	6	78	83	0 %	50 %	50 %	0 %	89898823
2	NC_007908	CAG	2	6	112	117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898823
3	NC_007908	GAC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898823
4	NC_007908	TTG	2	6	182	187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898823
5	NC_007908	TGGAT	2	10	203	212	20 %	40 %	40 %	0 %	89898823
6	NC_007908	CTG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898823
7	NC_007908	GCG	2	6	472	477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898823
8	NC_007908	CGG	2	6	528	533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898823
9	NC_007908	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898823
10	NC_007908	TGA	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898823
11	NC_007908	CACT	2	8	694	701	25 %	25 %	0 %	50 %	89898823
12	NC_007908	TGAT	2	8	713	720	25 %	50 %	25 %	0 %	89898823
13	NC_007908	T	6	6	730	735	0 %	100 %	0 %	0 %	89898823
14	NC_007908	AAG	2	6	755	760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898823
15	NC_007908	TGA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898823
16	NC_007908	C	6	6	901	906	0 %	0 %	0 %	100 %	89898823
17	NC_007908	CAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898823
18	NC_007908	T	6	6	981	986	0 %	100 %	0 %	0 %	89898823
19	NC_007908	ACT	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898823
20	NC_007908	CGGC	2	8	1210	1217	0 %	0 %	50 %	50 %	89898823
21	NC_007908	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	89898823
22	NC_007908	TGG	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898823
23	NC_007908	ACCAC	2	10	1313	1322	40 %	0 %	0 %	60 %	89898823
24	NC_007908	CGG	2	6	1347	1352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898823
25	NC_007908	CAG	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898823
26	NC_007908	ACAAG	2	10	1535	1544	60 %	0 %	20 %	20 %	89898824
27	NC_007908	ACC	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
28	NC_007908	CAC	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
29	NC_007908	CAC	2	6	1715	1720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
30	NC_007908	GC	3	6	1728	1733	0 %	0 %	50 %	50 %	89898824
31	NC_007908	TTGA	2	8	1737	1744	25 %	50 %	25 %	0 %	89898824
32	NC_007908	GCC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898824
33	NC_007908	GCC	2	6	1848	1853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898824
34	NC_007908	A	6	6	1912	1917	100 %	0 %	0 %	0 %	89898824
35	NC_007908	CTG	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898824
36	NC_007908	CTA	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898824
37	NC_007908	TCG	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898824
38	NC_007908	TGG	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898824
39	NC_007908	CTTCG	2	10	2051	2060	0 %	40 %	20 %	40 %	89898824
40	NC_007908	CT	3	6	2136	2141	0 %	50 %	0 %	50 %	89898824
41	NC_007908	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898824
42	NC_007908	CCAAG	2	10	2180	2189	40 %	0 %	20 %	40 %	89898824
43	NC_007908	ACC	2	6	2269	2274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898824
44	NC_007908	CAA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898824
45	NC_007908	GGC	2	6	2448	2453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898824
46	NC_007908	TGAT	2	8	2488	2495	25 %	50 %	25 %	0 %	89898824
47	NC_007908	GTG	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898824
48	NC_007908	GAA	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898825
49	NC_007908	C	6	6	2750	2755	0 %	0 %	0 %	100 %	89898825
50	NC_007908	CCA	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
51	NC_007908	CAC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
52	NC_007908	GGT	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898825
53	NC_007908	GAC	2	6	3020	3025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
54	NC_007908	TCAG	2	8	3053	3060	25 %	25 %	25 %	25 %	89898825
55	NC_007908	GAC	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
56	NC_007908	TGCA	2	8	3156	3163	25 %	25 %	25 %	25 %	89898825
57	NC_007908	GGC	2	6	3164	3169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
58	NC_007908	TCAA	2	8	3174	3181	50 %	25 %	0 %	25 %	89898825
59	NC_007908	CCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
60	NC_007908	CAG	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
61	NC_007908	GGT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898825
62	NC_007908	TGAGC	2	10	3475	3484	20 %	20 %	40 %	20 %	89898825
63	NC_007908	CAA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898825
64	NC_007908	GCGT	2	8	3498	3505	0 %	25 %	50 %	25 %	89898825
65	NC_007908	GAC	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
66	NC_007908	GCGT	2	8	3561	3568	0 %	25 %	50 %	25 %	89898825
67	NC_007908	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
68	NC_007908	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89898825
69	NC_007908	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
70	NC_007908	CACC	2	8	3751	3758	25 %	0 %	0 %	75 %	89898825
71	NC_007908	TGC	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
72	NC_007908	CG	3	6	3783	3788	0 %	0 %	50 %	50 %	89898825
73	NC_007908	TCA	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
74	NC_007908	GAC	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
75	NC_007908	AAG	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898825
76	NC_007908	CAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
77	NC_007908	CAG	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
78	NC_007908	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
79	NC_007908	ATC	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
80	NC_007908	GCG	2	6	4046	4051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
81	NC_007908	GC	3	6	4055	4060	0 %	0 %	50 %	50 %	89898825
82	NC_007908	GCC	2	6	4064	4069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
83	NC_007908	GC	3	6	4076	4081	0 %	0 %	50 %	50 %	89898825
84	NC_007908	CGC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
85	NC_007908	CCG	2	6	4194	4199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
86	NC_007908	GCT	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
87	NC_007908	CGG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898825
88	NC_007908	CGA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
89	NC_007908	ACC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
90	NC_007908	CAT	4	12	4411	4422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898825
91	NC_007908	GCT	3	9	4459	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
92	NC_007908	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898825
93	NC_007908	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898825
94	NC_007908	GCC	2	6	4528	4533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
95	NC_007908	AGA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898825
96	NC_007908	TCC	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89898825
97	NC_007908	CAC	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
98	NC_007908	GC	3	6	4688	4693	0 %	0 %	50 %	50 %	89898825
99	NC_007908	GCGCT	2	10	4751	4760	0 %	20 %	40 %	40 %	89898825
100	NC_007908	GC	3	6	4832	4837	0 %	0 %	50 %	50 %	89898825
101	NC_007908	CGC	2	6	4904	4909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
102	NC_007908	AGC	2	6	4928	4933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898825
103	NC_007908	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
104	NC_007908	GCT	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898825
105	NC_007908	ACC	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89898825
106	NC_007908	GCC	2	6	5199	5204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898825
107	NC_007908	TGA	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898825
108	NC_007908	ACCG	2	8	5237	5244	25 %	0 %	25 %	50 %	89898825
109	NC_007908	GC	3	6	5311	5316	0 %	0 %	50 %	50 %	89898825
110	NC_007908	GAT	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898826
111	NC_007908	GTC	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898826
112	NC_007908	TCT	2	6	5528	5533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89898826
113	NC_007908	TCA	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898826
114	NC_007908	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898826
115	NC_007908	T	6	6	5629	5634	0 %	100 %	0 %	0 %	89898826
116	NC_007908	T	6	6	5797	5802	0 %	100 %	0 %	0 %	89898826
117	NC_007908	TCA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898826
118	NC_007908	AAG	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898827
119	NC_007908	CGCA	2	8	6362	6369	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
120	NC_007908	C	6	6	6434	6439	0 %	0 %	0 %	100 %	89898827
121	NC_007908	CCGA	2	8	6444	6451	25 %	0 %	25 %	50 %	89898827
122	NC_007908	GCA	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
123	NC_007908	AGC	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
124	NC_007908	TTG	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89898827
125	NC_007908	CAACT	2	10	6537	6546	40 %	20 %	0 %	40 %	89898827
126	NC_007908	CGG	2	6	6578	6583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898827
127	NC_007908	CGGCCA	2	12	6607	6618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	89898827
128	NC_007908	T	6	6	6692	6697	0 %	100 %	0 %	0 %	89898827
129	NC_007908	GCA	2	6	6698	6703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898827
130	NC_007908	TTGA	2	8	6714	6721	25 %	50 %	25 %	0 %	89898827
131	NC_007908	GAT	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
132	NC_007908	CAGACC	2	12	6768	6779	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	89898827
133	NC_007908	GTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898827
134	NC_007908	GCT	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898827
135	NC_007908	ATC	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898827
136	NC_007908	GAT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
137	NC_007908	TGA	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898827
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270	NC_007908	GCA	2	6	12900	12905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89898833
271	NC_007908	TGA	2	6	12973	12978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898833
272	NC_007908	CAT	2	6	13004	13009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898833
273	NC_007908	GCC	2	6	13011	13016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898833
274	NC_007908	GGC	2	6	13017	13022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898833
275	NC_007908	GGC	2	6	13091	13096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898833
276	NC_007908	GTG	2	6	13154	13159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898833
277	NC_007908	GCC	2	6	13163	13168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898833
278	NC_007908	CAT	2	6	13187	13192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898833
279	NC_007908	CGG	2	6	13204	13209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898833
280	NC_007908	T	7	7	13455	13461	0 %	100 %	0 %	0 %	89898834
281	NC_007908	CAT	2	6	13486	13491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89898834
282	NC_007908	GGA	2	6	13537	13542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89898834
283	NC_007908	CTG	2	6	13631	13636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898834
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285	NC_007908	TGG	2	6	13674	13679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898834
286	NC_007908	GGT	2	6	13702	13707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898834
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288	NC_007908	GCTG	2	8	13872	13879	0 %	25 %	50 %	25 %	89898834
289	NC_007908	CCAG	2	8	13893	13900	25 %	0 %	25 %	50 %	89898834
290	NC_007908	GTG	2	6	13916	13921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898834
291	NC_007908	GCT	2	6	13960	13965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898834
292	NC_007908	GCC	2	6	13988	13993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898834
293	NC_007908	GCC	2	6	14020	14025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898834
294	NC_007908	GTG	2	6	14084	14089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89898834
295	NC_007908	GC	3	6	14096	14101	0 %	0 %	50 %	50 %	89898834
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299	NC_007908	GGC	2	6	14141	14146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898834
300	NC_007908	AAG	2	6	14219	14224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89898834
301	NC_007908	CTG	2	6	14333	14338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898834
302	NC_007908	GCG	2	6	14349	14354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89898834
303	NC_007908	CGT	2	6	14574	14579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89898835
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378	NC_007908	TGAT	2	8	19743	19750	25 %	50 %	25 %	0 %	89898839
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382	NC_007908	GCC	2	6	19832	19837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898839
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392	NC_007908	CCAC	2	8	20244	20251	25 %	0 %	0 %	75 %	89898839
393	NC_007908	ATG	2	6	20252	20257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89898839
394	NC_007908	GAG	2	6	20408	20413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89898839
395	NC_007908	GCC	2	6	20423	20428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89898839
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397	NC_007908	CGTGA	2	10	20564	20573	20 %	20 %	40 %	20 %	89898839
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